Whipple už vtedy špekuloval o jej pôvodcovi, ale trvalo takmer sto rokov, kým sa ho podarilo izolovať.
Whippleova choroba je zriedkavé, chronické infekčné ochorenie najčastejšie tenkého čreva, ale aj iných orgánov. Typické prejavy pacientov sú chronická hnačka, bolesti brucha a chudnutie. Niekedy je postihnutý aj mozog. Postihnutí ľudia sa sťažujú na dvojité videnie, zábudlivosť a nespavosť. Po 20 rokoch sa môže postihnutie srdca alebo mozgu skočiť smrťou. Muži sú postihnutí osemkrát častejšie ako ženy.
Chorobu, ktorá sa dá zvládnuť iba dlhoročným užívaním antibiotík, vyvoláva grampozitívna baktéria menom Tropheryma whipplei. Vedcom zo Sangerovho inštitútu v anglickom Cambridge a univerzitnej kliniky v nemeckom Heidelbergu sa podarilo prečítať jej genóm, ktorý predstavili v časopise The Lancet.
Genóm T. whipplei má iba 784 génov. Iné druhy baktérií potrebujú trojnásobný počet. Takýto minimalizmus u mikroorganizmov, ktoré sa špecializovali na čisto parazitický spôsob života, nie je však nič nové pod slnkom. A baktérie T. whipplei sú pravé parazity. Samé napríklad nemôžu produkovať tri aminokyseliny a preto ich prijímajú ako živiny od svojho hostiteľa.
Votrelci majú výborne vyvinutú ochranu seba samých. Baktéria T. whipplei má päť percent genómu rezervovaných na to, aby neustále menila štruktúru svojich povrchových proteínov. Týmto spôsobom mätie obranné bunky imunitného systému, ktoré sa orientujú pri likvidácii cudzorodých látok práve podľa takýchto znakov.