Grafické čipy pomáhajú v boji proti HIV

Dlhé roky ich využívali len hráči počítačových hier, no dnes bojujú proti chorobám.

(Zdroj: NVIDIA)

BRATISLAVA, ILLINOIS. Grafické čipy našli svoje využitie v medicíne. Vedci na univerzite v americkom štáte Illinois s ich pomocou dokázali rozkľúčovať presnú chemickú štruktúru proteínového obalu, ktorý chráni genetický materiál vírusu HIV.

Ten je kľúčom k jeho silnej nákazlivosti a pochopenie jeho štruktúry môže byť kľúčové pre vývoj nových a efektívnejších liekov.

64 miliónov

Na zistenie podrobností o štruktúre proteínového obalu sa vedci rozhodli využiť superpočítač Blue Waters, ktorý je vybavený troma tisíckami GPU akcelerátorov NVIDIA Tesla K20X.

Simulácia správania sa HIV vírusu pozostávala zo 64 miliónov atómov. Pre tak veľký počet simulovaných objektov je namiesto klasických procesorov efektívnejšie využiť grafické čipy, ktoré dokážu súčasne spracovať až niekoľko stoviek výpočtov.

"Bolo by veľmi zložité rozbehnúť simuláciu takýchto rozmerov bez superpočítača s modernými grafickými čipmi," hovorí Klaus Schulten, profesor fyziky na University of Illinois.

V simuláciách budú pokračovať

Na univerzite začali využívať výpočtovú silu moderných grafických čipov už pred piatimi rokmi, pričom podľa slov profesora Schultena im výrazne urýchlili výskum.

V simuláciách pomocou superpočítačov s grafickými jednotkami budú aj naďalej pokračovať, no už teraz plánujú rozšírenie jeho výkonu.

To im prinesie viac času pre náročné simulácie, ktoré sú potrebné pre získanie ďalších informácií o proteínovom obale HIV vírusu.

nvidia_tesla_k20x_k20_gpu_accelerator.jpg

NVIDIA Tesla vyzerá ako klasická grafická karta, no je určená pre náročné matematické výpočty.

Nie su to klasické grafiky

NVIDIA Tesla nie je klasická grafická karta, ale výpočtová jednotka, ktorá má s ňou len podobný hlavný čip.

Použitý superpočítač Blue Waters ich obsahuje až 3-tisíc, čo je ale stále len zlomok z najvýkonnejšieho superpočítača Titan. Ten má vyše 18-tisíc Tesla jednotiek a skoro 300-tisíc procesorových jadier.

Spotreba tejto zostavy presahuje osem megawattov, pričom za jednu sekundu zvládne spracovať 20-tisíc miliárd operácií.

Na spracúvanie osobných údajov sa vzťahujú Zásady ochrany osobných údajov a Pravidlá používania cookies. Pred zadaním e-mailovej adresy sa, prosím, dôkladne oboznámte s týmito dokumentmi.

Najčítanejšie na SME Tech

Hlavné správy zo Sme.sk

DOMOV

Lubyová dáva ruky preč od lukratívneho hotela, ktorý zhorel

Intenda sa sporí o Hotel Junior v Jasnej.

DOMOV

Talianski novinári spochybnili Ficove slová o telefonáte

Talianska prokuratúra vraj poprela, že by vedela o telefonáte s Vadalom.

Stĺpček šéfredaktorky

Robert Fico je v rozklade

Ako do Ficovej mafiánskej scény zapadajú policajné orgány?

Neprehliadnite tiež

Virtuálna realita PlayStation VR od Sony predstavuje najlepší spôsob, ako si technológiu vyskúšať.
Podcast Klik

Klik: Ako tučný Samsung poskladá trh s mobilmi

Komentovaný prehľad technologických správ.

Podcast Klik denníka SME.
Kôň s plachtou so zebrím vzorom.
Virtuálna realita v podaní PlayStation VR.

Inzercia - Tlačové správy

  1. Šesťročné dlhopisy teraz s výnosom až 7 % p.a.
  2. Štefánka by Pulitzer
  3. Trápi vás chrípka alebo prechladnutie? Vieme, ako s nimi zatočiť
  4. Reportáž: Takto sa na Slovensku vyrábajú cestoviny
  5. Zážitky z Pobaltia: Objavte Tallinn a Rigu
  6. Darček, s ktorým si na vás spomenie 365 dní v roku
  7. Šanca pre mladé talenty z oblasti umenia, vedy či športu
  8. Predpremiéra vynoveného VW Passat: Viac IQ, viac online
  9. Top destinácie a hotely na exotickú dovolenku v zime
  10. Stotisíc ľudí rozhodlo: Nadácia banky rozdelí štvrť milióna eur
  1. Na Slovensku sa vydáva najviac učiteľských preukazov
  2. Prihlásili ste sa ako dobrovoľník na Olympiádu v Tokiu?
  3. Šesťročné dlhopisy teraz s výnosom až 7 % p.a.
  4. Štefánka by Pulitzer
  5. Počuli ste už o integrovane pestovanej zelenine?
  6. Konferencia - EU support for research
  7. Slovensko má zasiahnuť robotizácia
  8. Viete, aké sú najlepšie možnosti sporenia pre mladých?
  9. Trápi vás chrípka alebo prechladnutie? Vieme, ako s nimi zatočiť
  10. Hitem jsou cyklopočítače Mio - pro zábavu i výkon
  1. Premýšľate o aute do 10 000 eur? Poradíme vám, ako nenaletieť 24 552
  2. Reportáž: Takto sa na Slovensku vyrábajú cestoviny 18 128
  3. Zážitky z Pobaltia: Objavte Tallinn a Rigu 8 362
  4. Darček, s ktorým si na vás spomenie 365 dní v roku 7 015
  5. Trápi vás chrípka alebo prechladnutie? Vieme, ako s nimi zatočiť 6 599
  6. Čo sa stalo s mojimi úsporami v druhom pilieri? 5 299
  7. Štefánka by Pulitzer 5 237
  8. Je lepšie menučko, alebo domáca strava? Týždeň sme varili doma 3 988
  9. Predpremiéra vynoveného VW Passat: Viac IQ, viac online 3 516
  10. Top destinácie a hotely na exotickú dovolenku v zime 2 985