Grafické čipy pomáhajú v boji proti HIV

Dlhé roky ich využívali len hráči počítačových hier, no dnes bojujú proti chorobám.

(Zdroj: NVIDIA)

BRATISLAVA, ILLINOIS. Grafické čipy našli svoje využitie v medicíne. Vedci na univerzite v americkom štáte Illinois s ich pomocou dokázali rozkľúčovať presnú chemickú štruktúru proteínového obalu, ktorý chráni genetický materiál vírusu HIV.

Ten je kľúčom k jeho silnej nákazlivosti a pochopenie jeho štruktúry môže byť kľúčové pre vývoj nových a efektívnejších liekov.

64 miliónov

Na zistenie podrobností o štruktúre proteínového obalu sa vedci rozhodli využiť superpočítač Blue Waters, ktorý je vybavený troma tisíckami GPU akcelerátorov NVIDIA Tesla K20X.

Článok pokračuje pod video reklamou

Simulácia správania sa HIV vírusu pozostávala zo 64 miliónov atómov. Pre tak veľký počet simulovaných objektov je namiesto klasických procesorov efektívnejšie využiť grafické čipy, ktoré dokážu súčasne spracovať až niekoľko stoviek výpočtov.

"Bolo by veľmi zložité rozbehnúť simuláciu takýchto rozmerov bez superpočítača s modernými grafickými čipmi," hovorí Klaus Schulten, profesor fyziky na University of Illinois.

V simuláciách budú pokračovať

Na univerzite začali využívať výpočtovú silu moderných grafických čipov už pred piatimi rokmi, pričom podľa slov profesora Schultena im výrazne urýchlili výskum.

V simuláciách pomocou superpočítačov s grafickými jednotkami budú aj naďalej pokračovať, no už teraz plánujú rozšírenie jeho výkonu.

To im prinesie viac času pre náročné simulácie, ktoré sú potrebné pre získanie ďalších informácií o proteínovom obale HIV vírusu.

nvidia_tesla_k20x_k20_gpu_accelerator.jpg

NVIDIA Tesla vyzerá ako klasická grafická karta, no je určená pre náročné matematické výpočty.

Nie su to klasické grafiky

NVIDIA Tesla nie je klasická grafická karta, ale výpočtová jednotka, ktorá má s ňou len podobný hlavný čip.

Použitý superpočítač Blue Waters ich obsahuje až 3-tisíc, čo je ale stále len zlomok z najvýkonnejšieho superpočítača Titan. Ten má vyše 18-tisíc Tesla jednotiek a skoro 300-tisíc procesorových jadier.

Spotreba tejto zostavy presahuje osem megawattov, pričom za jednu sekundu zvládne spracovať 20-tisíc miliárd operácií.

Najčítanejšie na SME Tech


Hlavné správy zo Sme.sk

DOMOV

Hovorili sme s Babindolčanmi: Bohatí susedia ich prekvapili

Ľuďom v Babindole sa nepáči, ak sa o nich hovorí ako o bohatej dedine. Zbohatlo podľa nich len pár jednotlivcov.

KOMENTÁRE

Snaha o minimalizáciu škody

Hlavní aktéri babindolskej kauzy nasadili špecialistov na krízovú komunikáciu.

ŠPORT

Za megapodvod minidištanc? Rusov možno na olympiáde omilostia

Rusi túžia kráčať pod svojou vlajkou.

Neprehliadnite tiež

Európska sonda bude pátrať po známkach života na Marse

Sonda bude pátrať predovšetkým po metáne.

Priťahujú sa protiklady? Čo hovorí veda o výbere partnera

Podobnosť a rozdielnosť sú dôležité najmä na začiatku vzťahu.

Vznikli skôr ako koleso. Stručná história erotických hračiek

Skutočný význam dodali umelým penisom antickí Gréci.

Za dva týždne dvesto zemetrasení. Čo to pre Yellowstone znamená

Otrasy môžu byť pokračovaním série zemetrasení z leta minulého roku.

Človek bránil robotovi od Boston Dynamics otvoriť dvere. Neúspešne

Pracovníci testovali, ako sa robot dokáže prispôsobiť problémom.

Inzercia - Tlačové správy


  1. Ste si istí, že svoj smartfón využívate naplno?
  2. Talent - vzdelanie - úspech
  3. Elektro-horúčka v podaní Volkswagenu
  4. Spoznáte týchto 11 filmov, v ktorých sa objavil McDonald’s?
  5. Nepýtajte od lekára antibiotiká pri chrípke či nádche
  6. Máte hypotéku a chcete lepšie spávať?
  7. 16 tipov na poznávacie zájazdy so slovenským sprievodcom
  8. Slovanet spustil LTE internet aj na juhu Tokaja
  9. Hľadá sa: Vzťah z rozumu. Darujte na Valentína predplatné SME.sk
  10. Dobrú chuť: príloha o dobrom jedle a varení v denníku SME
  1. Ak Vás nikdy nič nebolelo, nestrácajte čas čítaním tohto článku!
  2. Uvažujete nad solárnymi kolektormi? Získajte príspevok až 1750 €
  3. Ste si istí, že svoj smartfón využívate naplno?
  4. Príbeh tradičného družstva - príbeh Antonína Kvapila
  5. V Botanickej záhrade SPU otvorili jedinečnú výstavu orchideí
  6. Noc architektúry 2018
  7. V súťaži Záhrada, Park a Detail roka uspeli absolventi SPU
  8. Mieru spracovania odpadu zvyšujú automatizované linky
  9. Talent - vzdelanie - úspech
  10. Príbeh tradičného družstva - príbeh Iva Hlisnikovského
  1. 16 tipov na poznávacie zájazdy so slovenským sprievodcom 27 788
  2. Spoznáte týchto 11 filmov, v ktorých sa objavil McDonald’s? 19 810
  3. Mio MiVue 733 WiFi - snadno přeneste záznam autokamery do mobilu 12 824
  4. Máte hypotéku a chcete lepšie spávať? 6 520
  5. Dobrú chuť: príloha o dobrom jedle a varení v denníku SME 6 395
  6. Ste si istí, že svoj smartfón využívate naplno? 5 765
  7. Nepýtajte od lekára antibiotiká pri chrípke či nádche 3 660
  8. Nepýtajte od lekára antibiotiká pri chrípke či nádche 3 398
  9. Elektro-horúčka v podaní Volkswagenu 3 171
  10. Nové komorné bývanie v Karlovke? Karlove 3 101