Grafické čipy pomáhajú v boji proti HIV

Dlhé roky ich využívali len hráči počítačových hier, no dnes bojujú proti chorobám.

(Zdroj: NVIDIA)

BRATISLAVA, ILLINOIS. Grafické čipy našli svoje využitie v medicíne. Vedci na univerzite v americkom štáte Illinois s ich pomocou dokázali rozkľúčovať presnú chemickú štruktúru proteínového obalu, ktorý chráni genetický materiál vírusu HIV.

Ten je kľúčom k jeho silnej nákazlivosti a pochopenie jeho štruktúry môže byť kľúčové pre vývoj nových a efektívnejších liekov.

64 miliónov

Na zistenie podrobností o štruktúre proteínového obalu sa vedci rozhodli využiť superpočítač Blue Waters, ktorý je vybavený troma tisíckami GPU akcelerátorov NVIDIA Tesla K20X.

Simulácia správania sa HIV vírusu pozostávala zo 64 miliónov atómov. Pre tak veľký počet simulovaných objektov je namiesto klasických procesorov efektívnejšie využiť grafické čipy, ktoré dokážu súčasne spracovať až niekoľko stoviek výpočtov.

"Bolo by veľmi zložité rozbehnúť simuláciu takýchto rozmerov bez superpočítača s modernými grafickými čipmi," hovorí Klaus Schulten, profesor fyziky na University of Illinois.

V simuláciách budú pokračovať

Na univerzite začali využívať výpočtovú silu moderných grafických čipov už pred piatimi rokmi, pričom podľa slov profesora Schultena im výrazne urýchlili výskum.

V simuláciách pomocou superpočítačov s grafickými jednotkami budú aj naďalej pokračovať, no už teraz plánujú rozšírenie jeho výkonu.

To im prinesie viac času pre náročné simulácie, ktoré sú potrebné pre získanie ďalších informácií o proteínovom obale HIV vírusu.

nvidia_tesla_k20x_k20_gpu_accelerator.jpg

NVIDIA Tesla vyzerá ako klasická grafická karta, no je určená pre náročné matematické výpočty.

Nie su to klasické grafiky

NVIDIA Tesla nie je klasická grafická karta, ale výpočtová jednotka, ktorá má s ňou len podobný hlavný čip.

Použitý superpočítač Blue Waters ich obsahuje až 3-tisíc, čo je ale stále len zlomok z najvýkonnejšieho superpočítača Titan. Ten má vyše 18-tisíc Tesla jednotiek a skoro 300-tisíc procesorových jadier.

Spotreba tejto zostavy presahuje osem megawattov, pričom za jednu sekundu zvládne spracovať 20-tisíc miliárd operácií.

Najčítanejšie na SME Tech


Hlavné správy zo Sme.sk

ŠPORT

Dres Neapola je mojou druhou kožou, tvrdí Hamšík. Slovák dokázal nevídanú vec.

Slovák Marek Hamšík vyrovnal klubový rekord Diega Maradonu.

KOMENTÁRE

Rok 1997: Keď Slovensko ostatným len zamávalo

Mečiar napĺňal učenie: Ak nás nechcú na Západe, pôjdeme na Východ.

TECH

Ako sa rozprávať s popieračmi vedy cez Vianoce a nehádať sa

Skúste sa zdržať okamžitého menovania a faktov.

EKONOMIKA

Plánujete živý stromček? Ako ho uskladniť, aby vydržal do Vianoc

Dobre uskladnený stromček by mal bez problémov vydržať.

Neprehliadnite tiež

OBJEKTÍV

Spojené štáty odtajnili ďalšie desiatky videí z testov jadrových bômb

Niektoré kamery zachytili výbuch v rýchlosti 2400 snímkov za sekundu.

Ako sa nepohádať cez Vianoce a presvedčiť popieračov vedy

Skúste sa zdržať okamžitého menovania a faktov a radšej porozumejte, prečo sa tak ľudia cítia.

TECH_FM

Mimozemská loď? Pri čudnom objekte pochybujú aj vedci

Cez našu slnečnú sústavu preletelo teleso, ktoré prišlo z veľkej diaľky.

Vlasy v odtoku a mokré ponožky. Desať vecí, ktoré ľudia nenávidia najviac

Čím sú ľudia starší, tým radšej majú kozí syr aj sami seba.

Už nie sme jediní s ôsmimi planétami. Objavili miniverziu našej Slnečnej sústavy

Sústava sa nachádza vyše 2500 svetelných rokov od Zeme v súhvezdí Drak.

Inzercia - Tlačové správy


  1. Legendárna Transsibírska magistrála
  2. Volkswagen a jeho štedrá nádielka modelov
  3. Týchto 18 rád ako ušetriť som mal počuť ešte pred osemnástkou
  4. Venujte na Vianoce darček plný informácií!
  5. Päť faktorov, prečo môže skolabovať slovenský dôchodkový systém
  6. Ceny elektriny rastú. Firmy ale môžu ušetriť
  7. Kam chodí Gordulič na vtipy? Ako sa rodí Grape? Zisti to sám
  8. Top First moment dovolenky na leto 2018
  9. Hyundai Kona prekvapí výbavou aj dizajnom
  10. Na tohtoročných trhoch pred Auparkom vystúpi aj Katka Koščová
  1. Legendárna Transsibírska magistrála
  2. Auto ako vianočný darček, rastie záujem o zánovné vozidlá
  3. Vianočný bázar chalaňov
  4. Vianočné mecheche 2017
  5. Volkswagen a jeho štedrá nádielka modelov
  6. Študentskou osobnosťou Slovenska Ing. Martina Majorošová
  7. Majstrovstvá Stavebnej fakulty STU v Bratislave v plávaní 2017
  8. Týchto 8 kritérií by mal kvalitný kolagén spĺňať
  9. Beam Suntory zaznamenal silný rast predaja po zmene distribútora
  10. Zamestnanci a študenti EU v BA darovali radosť a vyčarili úsmev
  1. Legendárna Transsibírska magistrála 29 132
  2. Týchto 18 rád ako ušetriť som mal počuť ešte pred osemnástkou 6 539
  3. Päť faktorov, prečo môže skolabovať slovenský dôchodkový systém 3 625
  4. Volkswagen a jeho štedrá nádielka modelov 2 802
  5. Naše mobilné bankovníctvo si prišli vyskúšať novinári z Rakúska 2 529
  6. Hyundai Kona prekvapí výbavou aj dizajnom 1 386
  7. Top First moment dovolenky na leto 2018 1 330
  8. Kam chodí Gordulič na vtipy? Ako sa rodí Grape? Zisti to sám 1 279
  9. Venujte na Vianoce darček plný informácií! 1 073
  10. Týchto 8 kritérií by mal kvalitný kolagén spĺňať 950