Vedci dekódovali genóm divej trávy

Podrobne poznáme DNA prvého divo rastúceho zástupcu skupiny tráv, do ktorej patria aj pšenica a jačmeň. Získané poznatky sľubujú vyšľachtenie kvalitnejších plodín a vhodnejších odrôd pre výrobu biopalív.

NORWICH/CORVALLIS.

V časopise Nature to oznámilo početné medzinárodné výskumné konzorcium nazvané Brachypodium Initiative (Iniciatíva Brachypodium) na čele s Michaelom Bevanom zo Strediska Johna Innesa v Norwichi (Veľká Británia).

V konzorciu popri jeho inštitúcii zohrali hlavnú úlohu Spojený genómový ústav pri Ministerstve energetiky USA, Ministerstvo poľnohospodárstva USA a Oregonská štátna univerzita v Corvallise (USA).

Členovia konzorcia stanovili poradie písmen v celej DNA jednoročnej trávy druhu Brachypodium distachyon, ktorá voľne rastie v Stredomorí a na Blízkom východe. Má iba malý poľnohospodársky a všeobecne ekonomický význam.

Najcennejšie je na nej to, čo sa dá jej prostredníctvom vyzvedieť o iných trávach s väčšími a zložitejšími genómami, ktoré sa skúmajú obťažne napríklad pšenica má celkove päťkrát väčší genóm ako človek.

Produkcia potravín je základom ľudskej civilizácie. Prevažnú časť jej objemu, ako priamo pre ľudskú výživu, tak pre výrobu krmovín, predstavujú plodiny z kategórie zrnovín, zastupujúce tri rôzne skupiny, presnejšie podčeľade, tráv: kukurica, ryža a práve pšenica.

Genóm brachypodia slovenský názov rodu Brachypodium je mrvica je vôbec prvý divej trávy a súčasne prvého člena podčeľade tráv Pooideae, počtom druhov vyše 3000 zrejme najväčšej, do ktorej patria pšenica, jačmeň a viaceré dôležité pastvinové trávy, ktoré ešte iba čakajú na úplné sekvenovanie svojej DNA. Trávy, čeľaď Poaceae, majú vyše 600 rodov a vyše 10.000 druhov. Ryža je z podčeľade Ehrhartoideae, kukurica z Panicoideae.

Základný genetický materiál brachypodia je pomerne malý. Tvorí ho približne 272 miliónov písmen DNA (v prípade človeka sú to vyše tri miliardy). Jeho analýza však poskytla dôležité poznatky o evolúcii a zväčšovaní genómov tráv. Poslúžia tiež k navigácii v blízko príbuzných, avšak ďaleko väčších a zložitejších genómoch pšenice a jačmeňa.

Počet génov, kódujúcich bielkoviny, vedci v prípade brachypodia stanovili na 25.532, čo je menej ako pri ryži, ciroku a arábke, ale zrejme viac ako pri človeku.

Naša analýza genómu brachypodia je kľúčový zdroj pre zabezpečenie trvalo udržateľných dodávok potravín, krmiva a paliva na základe zavedených plodín, ako sú pšenica, jačmeň a pastvinové trávy, ako aj pre vyšľachtenie odrôd pre produkciu biopalív a celkovo energie z obnoviteľných zdrojov.

Túto trávu už rozsiahle využívajú šľachtitelia plodín, aby v pšenici a jačmeni identifikovali jednotlivé gény, pričom definuje nové prístupy k veľkomeradlovej genómovej analýze týchto plodín, keďže sme v jej genóme odhalili vysoký stupeň zachovávania génovej štruktúry a organizácie, povedal Michael Bevan.

Brachypodium je laboratórne výhodné aj kvôli svojmu rýchlemu životnému cyklu a veľmi kompaktnému rastu. Poznatky o ňom pomôžu určiť funkcie génov v pozadí produktivity plodín z čeľade tráv. Základná medzinárodná databáza o genóme brachypodia, BrachyBase, sa nachádza na Oregonskej štátnej univerzite a je voľne prístupná vedcom.

Zvlášť dôležité sú výsledky porovnania genómu brachypodia s už dekódovanými genómami iných, hospodársky oveľa dôležitejších tráv, ryže a ciroku (patrí do skupiny kukurice), ako aj vôbec prvej rastliny so známym genómom, arábky Thalovej, čo je príbuzná horčice.

Hlavné zdroje: Nature z 11. februára 2010; Komuniké John Innes Centre a Oregon State University, obe z 10. februára 2010.

Najčítanejšie na SME Tech


Hlavné správy zo Sme.sk

TECH

Mesiac som žil v inteligentnej domácnosti. A takto to dopadlo

Moderná, zábavná a zaujímavá. Inteligentná domácnosť je ale drahá a slovenským príkazom zatiaľ nerozumie.

KOMENTÁRE

Nová česká celebrita, hlúpa Mary a budúcnosť ľavosúdia (Schutzov týždeň)

Proti „ideám“ Sme rodina je šuvix aj nový „sociálny balík“ Smer-SNS-HíD.

SVET

Rozhoduje sa o budúcnosti sveta, čo plánujú lídri (Globsec naživo)

Lídri, vojaci a odborníci sa rozprávajú o hrozbách.

SVET

Američania obkľučujú Severnú Kóreu. Tentoraz nejde o bluf

Pri Kórejskom polostrove sú lietadlové lode.

Neprehliadnite tiež

Vzdali sa ropy, ponúknu tenisky z morských rias

Nerozpadnú sa po jednom daždi, nový materiál je určený na štandardné použitie.

Desatina Američanov opustila autá, presunuli sa k Uberu

Uber a Lyft menia spotrebiteľské návyky, niektorí im veria tak ako vlastnému autu.

Kardiostimulátory majú tisíce bezpečnostných IT chýb. Zdravotníci bezpečnosť zanedbali

Má držať rytmus srdca, stačí však hackerský útok a kardiostimulátor môže zabíjať.

Na čom hrať hry? Na PC či konzolách?

Porovnávať má zmysel hlavne produkty najväčších hráčov na trhu, keďže herným počítačom dokážu plnohodnotne konkurovať iba konzoly od Sony a Microsoftu.

Inzercia - Tlačové správy


  1. 14 tipov na exotickú dovolenku, ktorú si môžete dovoliť (aj vy)
  2. Štatutári, máte už prístup k elektronickej schránke?
  3. Zabudnite na nové a neekologické PC. Je tu Refurbished!
  4. Volkswagen Arteon je výkladná skriňa technológií
  5. Yeme chce byť výnimočný obchod aj vďaka výnimočným zamestnancom
  6. Lepšie bývať na vidieku, alebo v meste? Hľadali sme výhody
  7. Poznáte pôvod slovenských slov? Otestujte sa
  8. Plavba po Karibiku na luxusnej lodi
  9. Hyundai H350 je dokonale spoľahlivým partnerom pre biznis
  10. Študenti majú na získanie 30 € ešte 20 dní
  1. Aj vy môžete mať pekný trávnik, poradí vám expert
  2. Výrobky, ktoré chutia a voňajú ako z domácej zabíjačky
  3. 14 tipov na exotickú dovolenku, ktorú si môžete dovoliť (aj vy)
  4. Profesionálne sa predaj nehnuteľností dá robiť jedine exkluzívne
  5. HÝBSA Slovensko odštartovalo turné po Slovensku. Buďte pri tom!
  6. Každý štvrtý 70-tnik na Slovensku má cukrovku, pribúdajú mladší
  7. 5 hviezdičkové apartmány priamo na pobreží - Dubrovník
  8. Stavba domu na kľúč – úspora času aj financií
  9. Štatutári, máte už prístup k elektronickej schránke?
  10. Nová veľvyslankyňa Turecka na návšteve EU v Bratislave
  1. Poznáte pôvod slovenských slov? Otestujte sa 15 522
  2. Lepšie bývať na vidieku, alebo v meste? Hľadali sme výhody 10 594
  3. Plavba po Karibiku na luxusnej lodi 7 289
  4. Volkswagen Arteon je výkladná skriňa technológií 6 371
  5. Čím všetkým som si prešla, aby som sa naučila po anglicky 6 335
  6. Yeme chce byť výnimočný obchod aj vďaka výnimočným zamestnancom 5 838
  7. Hyundai H350 je dokonale spoľahlivým partnerom pre biznis 5 531
  8. 14 tipov na exotickú dovolenku, ktorú si môžete dovoliť (aj vy) 4 889
  9. Zabudnite na nové a neekologické PC. Je tu Refurbished! 4 557
  10. Domácnosť, ktorá šetrí sama? Aj u nás je to už realitou 4 262