SME
Nedeľa, 20. október, 2019 | Meniny má Vendelín

Genóm z doby ľadovej odložia na ľad?

Po úspešnom začiatku sekvenovania časti genómu mamuta teraz hrozí jeho odloženie na ľad. Ako napísal New Scientist, jedinou, ale závažnou prekážkou na ceste zmapovania génov z jadra bunky tohto vymretého pravekého obra z doby ľadovej sú peniaze.

"Vlajková loď" doby ľadovej - mamut. Nájdu vedci peniaze na mapovanie jeho kompletnej dedičnej informácie? ILUSTRÁCIA - ČTK/AP/SCIENCE

Zatiaľ iba mitochondriálna

Hendrik Poinar z McMasterovej univerzity v kanadskom Hamiltone (Ontario) a jeho tím veria, že sekvenovanie genómu vymretých zvierat dovolí získať inak nedostupné dáta o ich evolučnej histórii, populácii, rozmanitosti a iných kľúčových rysoch. Rozlúštenie genómu mamuta by pomohlo vyriešiť záhadu, čo vlastne zahubilo toto zviera na konci doby ľadovej pred približne 12 000 rokmi. Možno aj čosi napovie o zániku megafauny, ktorá tieto obľúbené zvieratá pravekých detských rozprávok sprevádzala.

Doteraz je jedinou známou sekvenciou, ktorú sa podarilo získať z fosílnych zvyškov mamutov, mitochondriálna DNA. Tá sa nachádza mimo bunkového jadra v mnohých kópiách, preto je jednoduchšie ju získať. Jadrová DNA je však oveľa tvrdší oriešok, pretože je podstatne dlhšia, a jadro obsahuje iba dva reťazce. Ak sú porušené, musia sa doplniť ďalšou prácnou analýzou. Práve jadrová DNA je však kľúčom ku kompletnej dedičnej informácii. Doteraz sa podarilo sekvenovať iba niekoľko mamutích jadrových génov. Práve vďaka tímu Poinara a ďalších genetikov.

Úspešný začiatok

V januári Poinarov tím spolu s tímom Rossea MacPheea z Amerického prírodopisného múzea v New Yorku ohlásili, že začali analyzovať mamutie gény s použitím kvalitatívne nového zariadenia. To isté používa aj fínsko-americký tím, ktorý práve v týchto dňoch ohlásil sekvenovanie doteraz najdlhšieho úseku DNA neandertálca z jaskyne Vindija (pozri Týždeň vo vede). Poinar s kolegami sekvenoval 28 miliónov bázových párov ("písmen") z malého fragmentu DNA. Počítačovou analýzou porovnali 13 miliónov týchto báz s publikovaným genómom afrického slona. Zhoda medzi mamutím a sloním genómom bola 98,55 percenta, čo zodpovedá evolučnému rozchodu oboch živočíchov približne pred piatimi miliónmi rokov. Naozaj pozoruhodný začiatok.

V októbri Poinar oznámil na stretnutí Spoločnosti pre paleontológiu stavovcov v Ottawe, že vďaka novej technológii vedci zanalyzovali ďalších 140 miliónov párov báz mamutej DNA, čím sa opäť o čosi rozšírili znalosti o genóme mamuta.

"Berieme všetko"

Na ďalšiu prácu v oveľa širšom rozsahu však genetikom chýba pol milióna dolárov (nová technológia sekvenovania genómu je nielen rýchla, ale aj drahá). New Scientist cituje slová MacPheea: "Prijímame akékoľvek šeky v akejkoľvek konvertibilnej mene."

Mamut je logickým začiatkom štúdia veľkých vyhynutých živočíchov doby ľadovej. Aj preto, že vo večne zamrznutej pôde, permafroste, nie je núdza o zvyšky mamutích fosílií. Zvlášť nádejná je skutočnosť, že genóm mamuta sa v mnohom zhoduje s moderným africkým slonom. Porovnanie oboch genómov dovolí vylúčiť sekvencie, ktoré sa do pôvodnej DNA dostali až potom, čo ležala v pôde (napríklad DNA pôdnych baktérií).

Úspešné "prečítanie" mamutieho genómu by nepochybne mohlo byť začiatkom mapovania iných vymretých druhov. Francúzsky vedec Bernard Buigues pozbieral a uložil zvyšky z viac ako tisíc zmrznutých fosílií zvierat z doby ľadovej vrátane pižmoňa severského, losa a soba karibu, ktoré vykopal v jaskyni v sibírskom permafroste. Buignes spolupracuje s tímom Poinara. Materiálu na štúdium by teda malo byť dosť. (ač)

Najčítanejšie na SME Tech

Inzercia - Tlačové správy

  1. Bývať v novom sa dá aj bez hypotéky (a založenia nehnuteľnosti)
  2. Karibik: Dokonalý oddych v špičkových hoteloch
  3. IBA DNES: Získajte plný prístup na SME.sk na 30 dní zadarmo
  4. Ojazdené pneumatiky odovzdajte, šetríte tak životné prostredie
  5. Lidl je odteraz všade! Vitajte v Lidl e-shope
  6. Výskumný park v Rakúsku zistil, ako sa býva najzdravšie
  7. Limitovaná ponuka: balík SME.sk + DIGI GO so zľavou až 52 %
  8. Nestarnú, ale dozrievajú
  9. Rýchlejšie doma. Už čoskoro.
  10. Zanzibar: Čo treba vidieť v africkom raji
  1. Pripojte sa na nový internet už aj v oblasti Gemera a Novohradu
  2. Na Kysuciach budete môcť surfovať na internete rýchlejšie
  3. Na Orave dobre aj s novým optickým internetom
  4. Aj do Liptovského Mikuláša dorazí nová optická sieť
  5. Najnovšia ponuka optického internetu na Spiši
  6. V oblasti Prešova budete môcť využiť nový optický internet
  7. V okolí Levíc budete mať možnosť využiť nový, rýchly internet
  8. Moderný a spoľahlivý internet aj na Hornom Zemplíne
  9. Surfujte na novej optickej sieti aj na Dolnom Zemplíne
  10. Už aj v Košiciach sa pripojíte do modernej optickej siete
  1. IBA DNES: Získajte plný prístup na SME.sk na 30 dní zadarmo 15 868
  2. Výskumný park v Rakúsku zistil, ako sa býva najzdravšie 15 133
  3. Lidl je odteraz všade! Vitajte v Lidl e-shope 14 441
  4. Bývať v novom sa dá aj bez hypotéky (a založenia nehnuteľnosti) 8 447
  5. Limitovaná ponuka: balík SME.sk + DIGI GO so zľavou až 52 % 8 012
  6. Vysokoškoláci zarobia už o 587 eur viac ako stredoškoláci 7 973
  7. 5 rád Ľudmily Kolesárovej, ako napísať projekt a získať grant 7 608
  8. Karibik: Dokonalý oddych v špičkových hoteloch 7 267
  9. Čo na aute vymyslela žena a čo výrobca telefónov? 7 224
  10. Zanzibar: Čo treba vidieť v africkom raji 6 599

Hlavné správy zo Sme.sk

Bývalý šéf tímu Gorila: Našli sme stámiliónové transakcie

Suma mala podľa bývalého šéfa tímu Gorila skončiť na účte, na ktorý mal Jirko Malchárek alebo jeho blízki prístup.

Šéf vyšetrovacieho tímu Gorila Lukáš Kyselica.
Komentár Petra Schutza

Šance vyzerajú byť jedna k jednej

Ďalej sa minimalizuje pravdepodobnosť rozchodu bez dohody.

Peter Schutz
Michaela Žureková

Neprehliadnite tiež

Kosti bojovníkov, ktorí padli v bitke pri rieke Tollense pred približne 3300 rokmi. V Európe predstavuje vôbec prvý dôkaz o prehistorickom bojisku.
Ostrov Bogoslof odfotený 10. januára 2017.
V Luxore našli 30 starovekých rakví.
Pozostatky veľryby, na ktorých si pochutnávajú hlbokomorské živočíchy.