Genóm z doby ľadovej odložia na ľad?

Po úspešnom začiatku sekvenovania časti genómu mamuta teraz hrozí jeho odloženie na ľad. Ako napísal New Scientist, jedinou, ale závažnou prekážkou na ceste zmapovania génov z jadra bunky tohto vymretého pravekého obra z doby ľadovej sú peniaze.

"Vlajková loď" doby ľadovej - mamut. Nájdu vedci peniaze na mapovanie jeho kompletnej dedičnej informácie? ILUSTRÁCIA - ČTK/AP/SCIENCE

Zatiaľ iba mitochondriálna

Hendrik Poinar z McMasterovej univerzity v kanadskom Hamiltone (Ontario) a jeho tím veria, že sekvenovanie genómu vymretých zvierat dovolí získať inak nedostupné dáta o ich evolučnej histórii, populácii, rozmanitosti a iných kľúčových rysoch. Rozlúštenie genómu mamuta by pomohlo vyriešiť záhadu, čo vlastne zahubilo toto zviera na konci doby ľadovej pred približne 12 000 rokmi. Možno aj čosi napovie o zániku megafauny, ktorá tieto obľúbené zvieratá pravekých detských rozprávok sprevádzala.

Doteraz je jedinou známou sekvenciou, ktorú sa podarilo získať z fosílnych zvyškov mamutov, mitochondriálna DNA. Tá sa nachádza mimo bunkového jadra v mnohých kópiách, preto je jednoduchšie ju získať. Jadrová DNA je však oveľa tvrdší oriešok, pretože je podstatne dlhšia, a jadro obsahuje iba dva reťazce. Ak sú porušené, musia sa doplniť ďalšou prácnou analýzou. Práve jadrová DNA je však kľúčom ku kompletnej dedičnej informácii. Doteraz sa podarilo sekvenovať iba niekoľko mamutích jadrových génov. Práve vďaka tímu Poinara a ďalších genetikov.

Úspešný začiatok

V januári Poinarov tím spolu s tímom Rossea MacPheea z Amerického prírodopisného múzea v New Yorku ohlásili, že začali analyzovať mamutie gény s použitím kvalitatívne nového zariadenia. To isté používa aj fínsko-americký tím, ktorý práve v týchto dňoch ohlásil sekvenovanie doteraz najdlhšieho úseku DNA neandertálca z jaskyne Vindija (pozri Týždeň vo vede). Poinar s kolegami sekvenoval 28 miliónov bázových párov ("písmen") z malého fragmentu DNA. Počítačovou analýzou porovnali 13 miliónov týchto báz s publikovaným genómom afrického slona. Zhoda medzi mamutím a sloním genómom bola 98,55 percenta, čo zodpovedá evolučnému rozchodu oboch živočíchov približne pred piatimi miliónmi rokov. Naozaj pozoruhodný začiatok.

V októbri Poinar oznámil na stretnutí Spoločnosti pre paleontológiu stavovcov v Ottawe, že vďaka novej technológii vedci zanalyzovali ďalších 140 miliónov párov báz mamutej DNA, čím sa opäť o čosi rozšírili znalosti o genóme mamuta.

"Berieme všetko"

Na ďalšiu prácu v oveľa širšom rozsahu však genetikom chýba pol milióna dolárov (nová technológia sekvenovania genómu je nielen rýchla, ale aj drahá). New Scientist cituje slová MacPheea: "Prijímame akékoľvek šeky v akejkoľvek konvertibilnej mene."

Mamut je logickým začiatkom štúdia veľkých vyhynutých živočíchov doby ľadovej. Aj preto, že vo večne zamrznutej pôde, permafroste, nie je núdza o zvyšky mamutích fosílií. Zvlášť nádejná je skutočnosť, že genóm mamuta sa v mnohom zhoduje s moderným africkým slonom. Porovnanie oboch genómov dovolí vylúčiť sekvencie, ktoré sa do pôvodnej DNA dostali až potom, čo ležala v pôde (napríklad DNA pôdnych baktérií).

Úspešné "prečítanie" mamutieho genómu by nepochybne mohlo byť začiatkom mapovania iných vymretých druhov. Francúzsky vedec Bernard Buigues pozbieral a uložil zvyšky z viac ako tisíc zmrznutých fosílií zvierat z doby ľadovej vrátane pižmoňa severského, losa a soba karibu, ktoré vykopal v jaskyni v sibírskom permafroste. Buignes spolupracuje s tímom Poinara. Materiálu na štúdium by teda malo byť dosť. (ač)

Najčítanejšie na SME Tech


Inzercia - Tlačové správy


  1. Kedy sa refinancovanie oplatí?
  2. Zanzibar je plný lákadiel na dokonalú exotickú dovolenku
  3. Intímna hygiena – celoročná záležitosť
  4. Rastie nám pokrivená generácia?
  5. Pivovar Šariš podporí cestovný ruch v Prešovskom kraji
  6. Novinka v realitnom biznise! Zatiaľ dostupné len v Grand Koliba
  7. 3 mýty, ktorým ste možno uverili. Ale ako je to naozaj?
  8. FemFest 2017 ponúkne beh na opätkoch i koncert známej speváčky
  9. Plug-in, hybrid alebo elektromobil? Poradíme, ako správne vybrať
  10. Bývajte v budove, po ktorej sa prechádzal Schöne Náci
  1. Detské zúbky sú veda
  2. Štartujú jesenné módne dni v Poluse
  3. Zanzibar je plný lákadiel na dokonalú exotickú dovolenku
  4. Rastie nám pokrivená generácia?
  5. Intímna hygiena – celoročná záležitosť
  6. Pivovar Šariš podporí cestovný ruch v Prešovskom kraji
  7. AAA AUTO za päť rokov predalo 320 tisíc vozidiel
  8. Novinka v realitnom biznise! Zatiaľ dostupné len v Grand Koliba
  9. 3 mýty, ktorým ste možno uverili. Ale ako je to naozaj?
  10. FemFest 2017 ponúkne beh na opätkoch i koncert známej speváčky
  1. Zanzibar je plný lákadiel na dokonalú exotickú dovolenku 13 602
  2. 3 mýty, ktorým ste možno uverili. Ale ako je to naozaj? 11 023
  3. Rastie nám pokrivená generácia? 10 171
  4. Intímna hygiena – celoročná záležitosť 2 736
  5. Plug-in, hybrid alebo elektromobil? Poradíme, ako správne vybrať 2 308
  6. Novinka v realitnom biznise! Zatiaľ dostupné len v Grand Koliba 1 629
  7. Pivovar Šariš podporí cestovný ruch v Prešovskom kraji 1 527
  8. Kedy sa refinancovanie oplatí? 1 408
  9. Bývajte v budove, po ktorej sa prechádzal Schöne Náci 1 254
  10. FemFest 2017 ponúkne beh na opätkoch i koncert známej speváčky 862

Hlavné správy zo Sme.sk

ŠPORT

Peter Sagan: Superstar made in Slovakia

Začínal na sestrinom bicykli, dnes zarába šesť miliónov ročne. Príbeh najlepšieho cyklistu planéty.

ŠPORT

Peter Sagan: Superstar made in Slovakia

Začínal na sestrinom bicykli, dnes zarába šesť miliónov ročne.

SVET

Minúta po minúte: Choďte a voľte, vyzval nemecký prezident

Schulz už odovzdal hlas, Merkelová pôjde k urnám poobede.

Neprehliadnite tiež

Astronautka z NASA: Vieme, že sa niečo pokazí

Astronautka Dorothy Metcalf-Lindenburgerová hovorí, ako vyzerá tréning v NASA a ako sa astronauti pripravujú na zlyhania.

Rozšírená realita je zábavná aj užitočná. Skúste tieto aplikácie pre iPhone a iPad

Nová aktualizácia iOS 11 pre mobilné zariadenia od Apple priniesla aj ARKit. V ponuke sú prvé aplikácie a je s nimi zábava.

TECH_FM

Kontroverzný objav naznačuje, že praľudia sa mohli vyvinúť v Európe

Stopy dávneho tvora mätú vedcov. Odborníci sa sporia, komu patrili.

Strašia vás baktérie na mobile? Vymysleli "umývačku"

Nová nabíjačka dezinfikuje mobily, používa na to ultrafialové žiarenie.