Genóm z doby ľadovej odložia na ľad?

Po úspešnom začiatku sekvenovania časti genómu mamuta teraz hrozí jeho odloženie na ľad. Ako napísal New Scientist, jedinou, ale závažnou prekážkou na ceste zmapovania génov z jadra bunky tohto vymretého pravekého obra z doby ľadovej sú peniaze.

"Vlajková loď" doby ľadovej - mamut. Nájdu vedci peniaze na mapovanie jeho kompletnej dedičnej informácie? ILUSTRÁCIA - ČTK/AP/SCIENCE

Zatiaľ iba mitochondriálna

Hendrik Poinar z McMasterovej univerzity v kanadskom Hamiltone (Ontario) a jeho tím veria, že sekvenovanie genómu vymretých zvierat dovolí získať inak nedostupné dáta o ich evolučnej histórii, populácii, rozmanitosti a iných kľúčových rysoch. Rozlúštenie genómu mamuta by pomohlo vyriešiť záhadu, čo vlastne zahubilo toto zviera na konci doby ľadovej pred približne 12 000 rokmi. Možno aj čosi napovie o zániku megafauny, ktorá tieto obľúbené zvieratá pravekých detských rozprávok sprevádzala.

Doteraz je jedinou známou sekvenciou, ktorú sa podarilo získať z fosílnych zvyškov mamutov, mitochondriálna DNA. Tá sa nachádza mimo bunkového jadra v mnohých kópiách, preto je jednoduchšie ju získať. Jadrová DNA je však oveľa tvrdší oriešok, pretože je podstatne dlhšia, a jadro obsahuje iba dva reťazce. Ak sú porušené, musia sa doplniť ďalšou prácnou analýzou. Práve jadrová DNA je však kľúčom ku kompletnej dedičnej informácii. Doteraz sa podarilo sekvenovať iba niekoľko mamutích jadrových génov. Práve vďaka tímu Poinara a ďalších genetikov.

Úspešný začiatok

V januári Poinarov tím spolu s tímom Rossea MacPheea z Amerického prírodopisného múzea v New Yorku ohlásili, že začali analyzovať mamutie gény s použitím kvalitatívne nového zariadenia. To isté používa aj fínsko-americký tím, ktorý práve v týchto dňoch ohlásil sekvenovanie doteraz najdlhšieho úseku DNA neandertálca z jaskyne Vindija (pozri Týždeň vo vede). Poinar s kolegami sekvenoval 28 miliónov bázových párov ("písmen") z malého fragmentu DNA. Počítačovou analýzou porovnali 13 miliónov týchto báz s publikovaným genómom afrického slona. Zhoda medzi mamutím a sloním genómom bola 98,55 percenta, čo zodpovedá evolučnému rozchodu oboch živočíchov približne pred piatimi miliónmi rokov. Naozaj pozoruhodný začiatok.

V októbri Poinar oznámil na stretnutí Spoločnosti pre paleontológiu stavovcov v Ottawe, že vďaka novej technológii vedci zanalyzovali ďalších 140 miliónov párov báz mamutej DNA, čím sa opäť o čosi rozšírili znalosti o genóme mamuta.

"Berieme všetko"

Na ďalšiu prácu v oveľa širšom rozsahu však genetikom chýba pol milióna dolárov (nová technológia sekvenovania genómu je nielen rýchla, ale aj drahá). New Scientist cituje slová MacPheea: "Prijímame akékoľvek šeky v akejkoľvek konvertibilnej mene."

Mamut je logickým začiatkom štúdia veľkých vyhynutých živočíchov doby ľadovej. Aj preto, že vo večne zamrznutej pôde, permafroste, nie je núdza o zvyšky mamutích fosílií. Zvlášť nádejná je skutočnosť, že genóm mamuta sa v mnohom zhoduje s moderným africkým slonom. Porovnanie oboch genómov dovolí vylúčiť sekvencie, ktoré sa do pôvodnej DNA dostali až potom, čo ležala v pôde (napríklad DNA pôdnych baktérií).

Úspešné "prečítanie" mamutieho genómu by nepochybne mohlo byť začiatkom mapovania iných vymretých druhov. Francúzsky vedec Bernard Buigues pozbieral a uložil zvyšky z viac ako tisíc zmrznutých fosílií zvierat z doby ľadovej vrátane pižmoňa severského, losa a soba karibu, ktoré vykopal v jaskyni v sibírskom permafroste. Buignes spolupracuje s tímom Poinara. Materiálu na štúdium by teda malo byť dosť. (ač)

Na spracúvanie osobných údajov sa vzťahujú Zásady ochrany osobných údajov a Pravidlá používania cookies. Pred zadaním e-mailovej adresy sa, prosím, dôkladne oboznámte s týmito dokumentmi.

Najčítanejšie na SME Tech

Inzercia - Tlačové správy

  1. Premýšľate o aute do 10 000 eur? Poradíme vám, ako nenaletieť
  2. Doplňte si knižnicu o svetovú klasiku už od 99 centov
  3. Žiaci sa šikanovali, dnes si pomáhajú. Pomohlo sedem krokov
  4. Investment Advisory Guide for Slovakia
  5. Jazdili sme na novom Volkswagene T-Cross!
  6. Slovensko čaká najdôležitejšie politické rozhodnutie roka
  7. Obľúbené Tunisko sa vracia do ponuky dovoleniek na rok 2019
  8. Máte pri čítaní „krátke ruky“? Vitajte vo svete štyridsiatnikov
  9. Test LG OLED B8: špičkový 4K televízor za cenu, akú ste nečakali
  10. Netradičná dovolenka? Plavba Stredomorím aj s letenkami v cene
  1. Doplňte si knižnicu o svetovú klasiku už od 99 centov
  2. Žiaci sa šikanovali, dnes si pomáhajú. Pomohlo sedem krokov
  3. Forum Prešov má platné stavebné povolenie a začína s výstavbou
  4. Slávnostná inaugurácia rektora a dekanov fakúlt EU v Bratislave
  5. Investment Advisory Guide for Slovakia
  6. Ako naučiť vaše deti správne zaobchádzať s peniazmi?
  7. Spolupráca Katedry architektúry SvF s mestskou časťou Dúbravka
  8. Ročné cestovné poistenie vás chráni dlhšie a je výhodnejšie
  9. Podmienky predaja spoločnosti s.r.o., ktorá je platcom DPH
  10. Jazdili sme na novom Volkswagene T-Cross!
  1. Slovensko čaká najdôležitejšie politické rozhodnutie roka 24 907
  2. Premýšľate o aute do 10 000 eur? Poradíme vám, ako nenaletieť 23 589
  3. Netradičná dovolenka? Plavba Stredomorím aj s letenkami v cene 19 508
  4. Prievidzská firma je malý zázrak. Uznáva ju americké letectvo 15 336
  5. Test LG OLED B8: špičkový 4K televízor za cenu, akú ste nečakali 13 820
  6. Obľúbené Tunisko sa vracia do ponuky dovoleniek na rok 2019 12 399
  7. Máte pri čítaní „krátke ruky“? Vitajte vo svete štyridsiatnikov 6 603
  8. Príspevok až 1750 € môžu získať záujemcovia o solárne kolektory 4 497
  9. Žiaci sa šikanovali, dnes si pomáhajú. Pomohlo sedem krokov 4 024
  10. Ako veľmi eko sa dá byť vo firme s 2 300 zamestnancami? 3 647

Hlavné správy zo Sme.sk

DOMOV

Mistrík odstúpil z prezidentského súboja, podporil Čaputovú

Mistríkovo rozhodnutie ocenil aj prezident Kiska a tiež podporil Čaputovú.

KOMENTÁR PETRA TKAČENKA

Toto by Čaputová nemala zahodiť

Po dvadsiatich rokoch môže prvé kolo vyhrať blok mimo Smeru a HZDS.

AUTO

Prichádza malé SUV Škoda Kamiq. Aké sú naše prvé dojmy?

Zaboduje priestorom aj bohatou výbavou.

Neprehliadnite tiež

Google chce zmeniť herné odvetvie

Predstavil novú streamovaciu službu Stadia.

Sociálna sieť Google+ prestane fungovať začiatkom apríla 2019.
Prelet okolo rovníka, záber vznikol zo vzdialenosti 13 kilometrov.

Ľudia, ktorí po eskalátore kráčajú, sú tak trochu sebci

Ľudia v stoji potrebujú menej priestoru.

Ako používate eskalátor? Stojíte alebo kráčate po ľavej strane?
Karen Uhlenbecková.
Ilustračné foto.