ZNÁMY GENETIK J. CRAIG VENTER SPOLU S DESIATKOU ĎALŠÍCH AMERICKÝCH VEDCOV SA PODIEĽAL NA PREDBEŽNOM SEKVENOVANÍ GENÓMU PSA

Genetické tajomstvá nášho najlepšieho priateľa

Úspech jedenásťčlenného vedeckého tímu – predbežné zmapovanie genómu psa – má obrovský význam pre chovateľské a veterinárne účely.


 


Tentoraz sme sa nášmu najlepšiemu priateľovi naozaj pozreli až do tých najhlbších útrob. FOTO – SCIENCE


 

Možnosť porovnať psí genóm s genómami človeka a laboratórnych hlodavcov však prináša najmä veľa nových perspektív pre ľudskú medicínu.

Pomocník a priateľ

Pes domáci (Canis familiaris) je pomocníkom či miláčikom mnohých z nás. Človek psa domestikoval približne pred 10-15 000 rokmi, najpravdepodobnejšie v Číne. Nemožno však vylúčiť, že to bolo oveľa skôr. Dnes je na svete vyše 400 psích rás. Výrazne sa od seba líšia fyziognómiou, hoci je to stále to isté zviera. O psoch sa toho vie po medicínskej (lepšie povedané veterinárnej) stránke po človeku najviac. Vedci už zmapovali 360 psích dedičných chorôb, ktoré majú ľudské analógie.

Poznanie psieho genómu je zvlášť vítané aj vzhľadom na podrobne vedené plemenné knihy málopočetných a preto ľahko sledovateľných rás. Psy takisto často slúžia ako laboratórne zvieratá.

Psy majú 78 chromozómov, zatiaľ čo človek 46. Ich obsah sa po oddelení psej evolučnej línie od posledného spoločného predka všetkých mäsožravcov (Carnivora) rádu cicavcov, kam patria všetky psovité šelmy, dosť popresúval a premiešal.

Plody prvého kroku

Jedenásti americkí vedci z The Institute for Genomic Research (TIGR) a The Center for Advancement of Genomics v Rockville (štát Maryland, USA), uverejnili v časopise Science predbežnú verziu psieho genómu. Viedol ich Ewen Kirkness a J. Craig Venter, známy najmä v súvislosti s komerčne organizovaným úsilím o sekvenovanie ľudského genómu. Táto verzia psieho genómu je úplná asi iba na 80 percent a má aj ďalšie nevýhody. Vedci ho získali novou metódou sekvenovania, ktorá je veľmi rýchla a pomerne lacná. Nemožno ju však považovať za viac ako prvý krok a vedci už pracujú na dokonalejších verziách.

Tak či onak, aj tento prvý krok priniesol zaujímavé poznatky. Sekvenovanie nespočíva iba v uložení poradia báz do GenBank (medzinárodný „sklad“ informácií o genómoch organizmov). Ide predovšetkým o anotáciu, to znamená priradenie úsekov DNA jednotlivým génom a ďalej o priradenie funkcie týmto génom.

Psí genóm je pomerne malý. Tvorí ho 2,4 miliardy párov dusíkových báz (u človeka je to 2,9 miliardy). Hlavnou príčinou tohto rozdielu je vyšší podiel opakujúcich sa úsekov DNA človeka (46 percent genómu voči 31 percentám psieho a 38 percentám myšacieho).

Gény, nekódujúce sekvencie, evolúcia

Pes a človek majú však predsa len veľa spoločného. Plných 650 miliónov párov báz DNA psa, čiže vyše 25 percent jeho genómu, možno zoradiť „bok po boku“ ich ľudských náprotivkov. Navyše sa podarilo identifikovať psie ekvivalenty 18 473 z 24 567 anotovaných ľudských génov.

Zvlášť pozoruhodný je fakt, že sedem percent psieho genómu je úplne identických s ľudským a myšacím, v rámci sekvencií univerzálnych pre cicavcov. Z týchto spoločných sekvencií psa, človeka a myši však takmer polovica nekóduje žiadny gén. Z psieho genómu v skutočnosti kódujú gény iba necelé dve percentá. No až vyše štyri percentá nekódujúcej medzigénovej sekvencie má pes rovnaké ako človek. Táto časť genómu je zrejme nositeľom regulačných funkcií.

Sekvenovanie psieho genómu poskytlo dôkazy, že psia línia sa oddelila od spoločného predka všetkých cicavcov skôr ako myš a človek. Kým psy sú produktom evolúcie nadradu placentálnych cicavcov Laurasiatheria, človek a myš pochádzajú z nadradu Eurochontoglires. Pravda, človek a pes sú si na genetickej úrovni asi dvojnásobne podobnejší ako obaja vo vzťahu k myši – tá má totiž vyše dvojnásobnú frekvenciu výskytu mutácií v genóme.

Na rad príde šimpanz, krava a makak

Sekvenovanie psieho genómu významne posúva poznanie genetického základu cicavcov. Do roku 2005 by podľa plánu vedci mali zavŕšiť sekvenovanie genómov šimpanza, kravy a opice makaka rézus.

Komentátori sekvenovania psieho genómu Stephen O‘ Brien a William Murphy z National Cancer Institute vo Fredericku (štát Maryland, USA) v Science spomenuli aj výsledky nedávnej konferencie v prestížnom Whitehead Center of Genome Research pri MIT (Massachusetts Institute of Technology). Bádatelia sa na nej dohodli na užšom výbere 18 primátích a 28 neprimátích druhov, sekvenovanie genómov ktorých by bolo z biomedicínskeho hľadiska najprínosnejšie. Prispelo by tiež k poznaniu evolúcie zoologickej skupiny cicavcov, ktorých na Zemi žije 4600 druhov a do ktorej patríme aj my.

Najčítanejšie na SME Tech


Inzercia - Tlačové správy


  1. Ako sa developer prispôsobil nárokom kupujúceho
  2. 5 tipov ako na zdravé nôžky v škole
  3. 6 účinkov prírodného slovenského výrobku
  4. TAURIS výrobky na gril potešia gurmánov aj maškrtníkov
  5. Let s prestreleným srdcom: Samovraždy slovenských hercov
  6. Problémy s počatím? Čo vás čaká na ceste za dvomi čiarkami
  7. Ako pracujú horskí záchranári? Tieto veci by ste nemali podceniť
  8. Lety do exotiky už aj z Bratislavy
  9. Nonstop banka vo vrecku - aplikácia Mobil Banking
  10. Ako sme jazdili v socializme
  1. Očarujúca Srí Lanka: malý ostrov plný prekvapení
  2. 5 tipov ako na zdravé nôžky v škole
  3. Ako sa developer prispôsobil nárokom kupujúceho
  4. Už aj seniori presadajú do SUV
  5. 6 účinkov prírodného slovenského výrobku
  6. Americká ambasáda zaberá pozemky už rok bez nájomnej zmluvy
  7. Bratislava gets a new public space and park
  8. TAURIS výrobky na gril potešia gurmánov aj maškrtníkov
  9. Let s prestreleným srdcom: Samovraždy slovenských hercov
  10. Daikin predĺžil záruku na klimatizácie so službou Stand By Me
  1. Let s prestreleným srdcom: Samovraždy slovenských hercov 29 197
  2. Ako sme jazdili v socializme 3 481
  3. Ako sa developer prispôsobil nárokom kupujúceho 2 339
  4. Lety do exotiky už aj z Bratislavy 1 884
  5. 6 účinkov prírodného slovenského výrobku 1 792
  6. Problémy s počatím? Čo vás čaká na ceste za dvomi čiarkami 1 682
  7. TAURIS výrobky na gril potešia gurmánov aj maškrtníkov 1 485
  8. Ako pracujú horskí záchranári? Tieto veci by ste nemali podceniť 1 450
  9. 5 tipov ako na zdravé nôžky v škole 1 217
  10. Daikin predĺžil záruku na klimatizácie so službou Stand By Me 1 130

Hlavné správy zo Sme.sk

PLUS

Takto očividne kradnúť, to sa vymyká zvyklostiam, hovorieval Dzurinda

Peniaze na vedu sa na Slovensku rozdeľujú hlboko pod úrovňou civilizovaného sveta.

DOMOV

Michal Gučík o návšteve Danka: Možno mám len dobrý kávostroj

O vypovedaní koaličnej zmluvy som sa dozvedel z médií, tvrdí Gučík.

KOMENTÁRE

Počet superstarostov sa zvýšil o sto percent

Raslavický starosta je nový Vlado Ledecký.

Neprehliadnite tiež

Vypustili prvý satelit, ktorý vyrobili pomocou 3D tlačiarne

Satelity by mali byť vo vesmíre približne päť až šesť mesiacov.

Toto sú najlepšie čínske smartfóny (leto 2017)

Xiaomi, Vernee, Oukitel alebo Ulefone? Poradíme vám, ako sa nestratiť vo svete čínskych smartfónov.

Na dne morí sa hromadia plasty, môže za to aj zvláštne zviera

Vršovky nie sú vinníci, sú obeťami plastov.

V sobotu skoro ráno sú najkrajšie podmienky na pozorovanie Venuše

Tretí najjasnejší objekt sa na oblohe pripojí k Mesiacu.