ZNÁMY GENETIK J. CRAIG VENTER SPOLU S DESIATKOU ĎALŠÍCH AMERICKÝCH VEDCOV SA PODIEĽAL NA PREDBEŽNOM SEKVENOVANÍ GENÓMU PSA

Genetické tajomstvá nášho najlepšieho priateľa

Úspech jedenásťčlenného vedeckého tímu – predbežné zmapovanie genómu psa – má obrovský význam pre chovateľské a veterinárne účely.


 


Tentoraz sme sa nášmu najlepšiemu priateľovi naozaj pozreli až do tých najhlbších útrob. FOTO – SCIENCE


 

Možnosť porovnať psí genóm s genómami človeka a laboratórnych hlodavcov však prináša najmä veľa nových perspektív pre ľudskú medicínu.

Pomocník a priateľ

Pes domáci (Canis familiaris) je pomocníkom či miláčikom mnohých z nás. Človek psa domestikoval približne pred 10-15 000 rokmi, najpravdepodobnejšie v Číne. Nemožno však vylúčiť, že to bolo oveľa skôr. Dnes je na svete vyše 400 psích rás. Výrazne sa od seba líšia fyziognómiou, hoci je to stále to isté zviera. O psoch sa toho vie po medicínskej (lepšie povedané veterinárnej) stránke po človeku najviac. Vedci už zmapovali 360 psích dedičných chorôb, ktoré majú ľudské analógie.

Poznanie psieho genómu je zvlášť vítané aj vzhľadom na podrobne vedené plemenné knihy málopočetných a preto ľahko sledovateľných rás. Psy takisto často slúžia ako laboratórne zvieratá.

Psy majú 78 chromozómov, zatiaľ čo človek 46. Ich obsah sa po oddelení psej evolučnej línie od posledného spoločného predka všetkých mäsožravcov (Carnivora) rádu cicavcov, kam patria všetky psovité šelmy, dosť popresúval a premiešal.

Plody prvého kroku

Jedenásti americkí vedci z The Institute for Genomic Research (TIGR) a The Center for Advancement of Genomics v Rockville (štát Maryland, USA), uverejnili v časopise Science predbežnú verziu psieho genómu. Viedol ich Ewen Kirkness a J. Craig Venter, známy najmä v súvislosti s komerčne organizovaným úsilím o sekvenovanie ľudského genómu. Táto verzia psieho genómu je úplná asi iba na 80 percent a má aj ďalšie nevýhody. Vedci ho získali novou metódou sekvenovania, ktorá je veľmi rýchla a pomerne lacná. Nemožno ju však považovať za viac ako prvý krok a vedci už pracujú na dokonalejších verziách.

Tak či onak, aj tento prvý krok priniesol zaujímavé poznatky. Sekvenovanie nespočíva iba v uložení poradia báz do GenBank (medzinárodný „sklad“ informácií o genómoch organizmov). Ide predovšetkým o anotáciu, to znamená priradenie úsekov DNA jednotlivým génom a ďalej o priradenie funkcie týmto génom.

Psí genóm je pomerne malý. Tvorí ho 2,4 miliardy párov dusíkových báz (u človeka je to 2,9 miliardy). Hlavnou príčinou tohto rozdielu je vyšší podiel opakujúcich sa úsekov DNA človeka (46 percent genómu voči 31 percentám psieho a 38 percentám myšacieho).

Gény, nekódujúce sekvencie, evolúcia

Pes a človek majú však predsa len veľa spoločného. Plných 650 miliónov párov báz DNA psa, čiže vyše 25 percent jeho genómu, možno zoradiť „bok po boku“ ich ľudských náprotivkov. Navyše sa podarilo identifikovať psie ekvivalenty 18 473 z 24 567 anotovaných ľudských génov.

Zvlášť pozoruhodný je fakt, že sedem percent psieho genómu je úplne identických s ľudským a myšacím, v rámci sekvencií univerzálnych pre cicavcov. Z týchto spoločných sekvencií psa, človeka a myši však takmer polovica nekóduje žiadny gén. Z psieho genómu v skutočnosti kódujú gény iba necelé dve percentá. No až vyše štyri percentá nekódujúcej medzigénovej sekvencie má pes rovnaké ako človek. Táto časť genómu je zrejme nositeľom regulačných funkcií.

Sekvenovanie psieho genómu poskytlo dôkazy, že psia línia sa oddelila od spoločného predka všetkých cicavcov skôr ako myš a človek. Kým psy sú produktom evolúcie nadradu placentálnych cicavcov Laurasiatheria, človek a myš pochádzajú z nadradu Eurochontoglires. Pravda, človek a pes sú si na genetickej úrovni asi dvojnásobne podobnejší ako obaja vo vzťahu k myši – tá má totiž vyše dvojnásobnú frekvenciu výskytu mutácií v genóme.

Na rad príde šimpanz, krava a makak

Sekvenovanie psieho genómu významne posúva poznanie genetického základu cicavcov. Do roku 2005 by podľa plánu vedci mali zavŕšiť sekvenovanie genómov šimpanza, kravy a opice makaka rézus.

Komentátori sekvenovania psieho genómu Stephen O‘ Brien a William Murphy z National Cancer Institute vo Fredericku (štát Maryland, USA) v Science spomenuli aj výsledky nedávnej konferencie v prestížnom Whitehead Center of Genome Research pri MIT (Massachusetts Institute of Technology). Bádatelia sa na nej dohodli na užšom výbere 18 primátích a 28 neprimátích druhov, sekvenovanie genómov ktorých by bolo z biomedicínskeho hľadiska najprínosnejšie. Prispelo by tiež k poznaniu evolúcie zoologickej skupiny cicavcov, ktorých na Zemi žije 4600 druhov a do ktorej patríme aj my.

Najčítanejšie na SME Tech


Inzercia - Tlačové správy


  1. Pivný bar Senica: Miesto, kde objavíte, ako má chutiť pivo
  2. Volkswagen Golf: Viac, než facelift
  3. Plavba východným Stredomorím so slovenským sprievodcom
  4. Hotovosť, internet či karta? Najbezpečnejšie je platenie mobilom
  5. Už ste niekedy jedli v garáži? Tá v Trenčíne stojí za to
  6. Staré Dobré Mexiko: Už vieme prečo východniari chvália Šariš
  7. Objavte netušené možnosti nových firemných kreditných kariet
  8. Najväčšie first moment zľavy končia vo februári
  9. Boj s podvodníkmi stáčajúcimi odometre stojí bazáre státisíce
  10. Bezpečné a prestížne bývanie v Bratislave s novým symbolom mesta
  1. Pivný bar Senica: Miesto, kde objavíte, ako má chutiť pivo
  2. Projekt "Zvýšenie odborných kapacít v oblasti práce s mládežou"
  3. Malé knedličky, veľké dojmy
  4. Volkswagen Golf: Viac, než facelift
  5. Plavba východným Stredomorím so slovenským sprievodcom
  6. Projekt First Lego League podporila Nadácia Pontis
  7. Klienti majú často pocit, že potrebujú spracovať len projekt
  8. Na bolesti chrbta pomôžu kúpele
  9. Na bolesti chrbta pomôžu kúpele
  10. 3 úlohy, ktoré vyrieši minerálna vlna najlepšie
  1. Už ste niekedy jedli v garáži? Tá v Trenčíne stojí za to 11 808
  2. Hotovosť, internet či karta? Najbezpečnejšie je platenie mobilom 11 542
  3. Plavba východným Stredomorím so slovenským sprievodcom 8 013
  4. Staré Dobré Mexiko: Už vieme prečo východniari chvália Šariš 6 488
  5. Boj s podvodníkmi stáčajúcimi odometre stojí bazáre státisíce 5 912
  6. Prečo majú Slováci stále radšej hypotéku ako prenájom? 3 662
  7. Bezpečné a prestížne bývanie v Bratislave s novým symbolom mesta 3 500
  8. Najväčšie first moment zľavy končia vo februári 3 309
  9. Volkswagen Golf: Viac, než facelift 2 871
  10. Mäsovýroba Gašparík získala ocenenie Danubius Gastro 2017 2 462

Hlavné správy zo Sme.sk

EKONOMIKA

Osem zásadných zmien v hypotékach, ktoré odštartujú od marca

Kto si málo sporí a príliš často mení zamestnanie, dostane o niečo nižší úver ako doteraz.

KOMENTÁRE

Na obranu bratislavskej kaviarne

Kaviareň je so svojím dešpektom k spiatočníctvu pre vidiek trvalou výzvou.

BRATISLAVA

Bol priekopník – utečenec. Jeho meno zmizlo z novín aj z histórie

Václav Nedomanský má zo svetových šampionátov deväť medailí.

Neprehliadnite tiež

Civilizáciu Aztékov zničila európska zbraň, nevedeli proti nej bojovať

Za kolapsom rozvinutej juhoamerickej civilizácie môže byť aj pandémia paratýfusu.

Voda na Zemi aj vo vesmíre. Pozrite si najkrajšie zábery z kozmu za tento týždeň

Vedci predstavili tri mimozemské svety, kde by mohla byť voda aj život.

Pluto a jeho mesiace budú oficiálne ríšou mŕtvych

Nové názvoslovie pre systém trpasličej planéty sa inšpiruje aj mytológiou.

TECH_FM

NASA oznámila obrovský objav, prečo sú vedci takí nadšení

Veď je to „len“ ďalšia hviezdna sústava. Tak prečo toľko kriku? Vysvetľuje podcast TECH_FM.


Už ste čítali?

Domov NajnovšieNajčítanejšieDesktop