Mega bude nahrávané súbory šifrovať 2048-bitovým RSA kľúčom. Túto funkciu si majú manažovať užívatelia, Mega preto nebude vedieť o aké súbory ide, čo sťaží kontrolu obsahu úradmi. Dotcom pre portál TorrentFreak odhadol, že do piatich rokov bude až polovica súborov na webe zašifrovaná vďaka Mega. Web má mať totiž rozhranie pre vývojárov, ktorí môžu do svojich aplikácii či webov zakomponovať ukladanie na toto úložisko.
Zdroj: twitter.com/KimDotcom