Génový portrét nášho najlepšieho priateľa

Po človeku, myši, potkanovi a šimpanzovi je pes už piaty cicavec s podrobne sekvenovanou a analyzovanou DNA. Výsledky pomôžu v chovateľstve, evolučnej genetike i ľudskej a veterinárnej medicíne.

Psí svet rás je skutočne pestrý (vpravo sučka boxera Tasha, darkyňa zatiaľ najpodrobnejšie sekvenovanej psej DNA). FOTO - NATURE, NHGRI

Tí, čo nám rozumejú

Pes domáci (Canis familiaris) je domestikovaná forma vlka (Canis lupus). Ten spolu s ostatnými psovitými šelmami (Canidae), mačkovitými, medveďovitými a tuleňovitými patrí medzi mäsožravé cicavce (Carnivora). Canidae sa spomedzi mäsožravých cicavcov vyčlenili pred 40 miliónmi rokov. Pred 15 miliónmi rokov sa rozrôznili na hlavné skupiny, ako vlky, šakaly a líšky. K vlkovi má najbližšie kojot, evolučne sa rozišli iba pred jedným až dvoma miliónmi rokov.

Našimi najbližšími príbuznými v živočíšnej ríši sú ľudoopy, najmä šimpanz. Napriek tomu je to práve domestikovaný vlk, čiže pes, tvor, s ktorým máme najlepšie vzťahy. Príčinou je dlhé spolužitie s jeho dnes už vyše 400 uznanými rasami (samozrejme, vyšľachtenými v rôznych dobách).

Spoľahlivé dôkazy domestikácie psa pochádzajú spred zhruba 15-tisíc rokov. Najpravdepodobnejšie k nej došlo vo východnej Ázii. Podľa istých náznakov však človek spolunažíva so psom oveľa dlhšie, udáva sa až 50-tisíc či dokonca stotisíc rokov. To by vysvetľovalo jednak obrovskú empatiu, ktorú psy pre nás majú, jednak ich schopnosť s nami manipulovať, o čom chovatelia občas rozprávajú priam neuveriteľné veci.

Menej génov, viac chromozómov

Hoci pracovné sekvencie psieho genómu sú k dispozícii už niekoľko rokov a podrobná sa objavila vlani, ozajstným míľnikom výskumu psej DNA je dnešok. Vymedzuje ho článok Kerstin Lindbladovej-Tohovej z Broadovho ústavu pri Harvardovej univerzite a Massachusettskom technologickom inštitúte (USA) v najnovšom Nature. Článok ďalej priamo spolupodpísalo 45 vedcov, ďalších 190 je uvedených pod hlavičkou Broadskej sekvenovacej platformy. Okrem USA pochádzajú z Veľkej Británie a Francúzska.

Tím si vyžiadal radu od chovateľov a veterinárov, ktorú psiu rasu majú vybrať na dosiaľ najpodrobnejšie sekvenovanie. Napokon to bola sučka boxera Tasha, takže výsledná sekvencia nepokrýva samčí chromozóm Y.

Jej na 99 percent sekvenovanú DNA tvorí 2,4 miliardy bázových párov ("písmen" DNA). Pre porovnanie: človek ich má približne o pol miliardy viac. Psy však zasa majú 39 párov chromozómov, oproti našim 23 párom. Rozdiel vo veľkosti genómu možno vysvetliť menším počtom opakujúcich sa úsekov psej DNA. Zdá sa, že psy majú o čosi menej génov (19 300) ako ľudia, z ktorých skoro všetky majú ľudské náprotivky. No v určovaní počtu génov toho-ktorého organizmu sa bádatelia naučili byť opatrní.

Veľké porovnanie

Paralelne s článkom v Nature vychádza špeciálne číslo Genome Research, venované psím genómom. Obsahuje napríklad podrobné porovnanie sekvencií DNA pudlíka a boxera, ktoré vykonali Ewen Kirkness a Wei Wang zo známeho Ústavu genómového výskumu (TIGR, USA). Títo bádatelia sledovali krátke úseky DNA, vyskytujúce sa náhodne v genómoch mnohých organizmov blízko, alebo vo vnútri sekvencií génov. Pudlík a boxer sa v tomto ohľade líšia na 10 562 miestach genómu.

Porovnanie (na úrovni šesť percent genómu) s ďalšími deviatimi psími rasami - beaglom, labradorským retrieverom, nemeckým ovčiakom, talianskym chrtom, anglickým ovčiakom, bedlingtonským teriérom, portugalským vodným psom, aljašským malamutom a rotvajlerom - a piatimi divo žijúcimi psovitými šelmami (štyri typy vlka a kojot) ukázalo, že v rámci psovitých sa vyskytuje aspoň 20-tisíc takých rozdielov. Predstavujú akési majáky pre spájanie génov jednak s chorobami, jednak so špecifickými znakmi organizmu. Pes vďaka systematickému šľachteniu rás predstavuje unikátny genomický model. Po tomto podrobnom preskúmaní DNA tak aspoň o trochu lepšie rozumieme odhadom 400 miliónom našich dnes na svete žijúcich najbližších priateľov.

FOTO

Najčítanejšie na SME Tech


Inzercia - Tlačové správy


  1. Kedy sa refinancovanie oplatí?
  2. FemFest 2017 ponúkne beh na opätkoch i koncert známej speváčky
  3. Plug-in, hybrid alebo elektromobil? Poradíme, ako správne vybrať
  4. Bývajte v budove, po ktorej sa prechádzal Schöne Náci
  5. Trenčania to chcú mať všade blízko. Kde kupujú byty?
  6. ENGIE Services odovzdala do prevádzky novú kotolňu v Košiciach
  7. Poistenci VšZP už nebudú platiť 17 centov v lekárňach za recepty
  8. Potraviny typické pre váš región nájdete už aj v Kauflande
  9. Exotické destinácie s priamym letom z Viedne
  10. Zabudnite na nové a neekologické PC. Je tu Refurbished!
  1. FemFest 2017 ponúkne beh na opätkoch i koncert známej speváčky
  2. Slávnostná imatrikulácia SvF STU v Bratislave
  3. Unverzita vyTVORená nápadmi študentov!
  4. Slovenské mestá môžu využiť eurofondy na zelené strechy
  5. Plug-in, hybrid alebo elektromobil? Poradíme, ako správne vybrať
  6. Program obnovy chodníkov v Starom Meste schválený
  7. Stavebná fakulta STU získala certifikát EUR-ACE
  8. Stavebná fakulta STU získala certifikát EUR-ACE
  9. Príďte na Deň otvorených dverí v Novom Ružinove
  10. Študenti sa rozhodli zmeniť svoju školu
  1. Poistenci VšZP už nebudú platiť 17 centov v lekárňach za recepty 9 549
  2. Exotické destinácie s priamym letom z Viedne 3 255
  3. Lokalita pod Kolibou výrazne mení svoju tvár 3 096
  4. Trenčania to chcú mať všade blízko. Kde kupujú byty? 2 839
  5. Plug-in, hybrid alebo elektromobil? Poradíme, ako správne vybrať 2 825
  6. Potraviny typické pre váš región nájdete už aj v Kauflande 1 499
  7. Zabudnite na nové a neekologické PC. Je tu Refurbished! 1 493
  8. Bývajte v budove, po ktorej sa prechádzal Schöne Náci 1 452
  9. Kedy sa refinancovanie oplatí? 1 419
  10. ENGIE Services odovzdala do prevádzky novú kotolňu v Košiciach 958

Hlavné správy zo Sme.sk

DOMOV

Café Európa: Aká bude budúcnosť Česka a Slovenska v Európe

Aké je naše miesto v Európskej únii? Sledujte diskusiu naživo.

EKONOMIKA

Érsek sa rozhodol, bratislavské letisko chce dať do prenájmu

Minister predložil návrh na 30-ročnú koncesiu letiska.

SVET

Čoraz viac utečencov mieri na sever Európy cez Slovensko

V Rakúsku vojaci pomáhali pri klasickej policajnej činnosti.

Neprehliadnite tiež

Microsoft rozseká Windows 10 Mobile, chystá modulárnu Andromedu

Nová stratégia zníži náklady na vývoj i podporu. Microsoft chce byť dostupnejší pre výrobcov.

Geológ: Ochladili Zem a vyhubili ľudí. Našu planétu čaká supererupcia

Výbuch supervulkánu by bol aj dnes katastrofický, hovorí geochronológ Martin Danišík, ktorý publikoval v prestížnom vedeckom časopise.

Klimatológovia: Hurikány spôsobili tento rok najdrahšie škody v histórii

Čo hovoria odborníci na tohtoročnú rekordnú sezónu hurikánov.

Google začal linkovať adresy a telefónne čísla

Ak často prepisujete v mobile kontaktné údaje, už to nebudete musieť opakovať.